Gedankenstücke

Na gut, nicht ganz, und auch die Petrischale war es nicht weil Lenski und seine Kollegen E. coli in Flüssigmedium kultivieren. Aber immerhin die Evolution passt.

Das Team um Lenski lässt schon seit gut 20 Jahren ihr Langzeitexperiment zur Evolution laufen. Gestartet haben sie mit 12 Flaschen genetisch identischer Bakterien und haben diese mal vor sich hinmachen lassen. Über recht wenige Generationen haben sie sich dort auch an die Bedingungen evolutiv angepasst und lebten fröhlich vor sich hin und ernährten sich von der gefütterten Glucose.

Doch mittlerweile, gut 30000 Generationen später haben sich Bakterien in einer der 12 Flaschen verändert, sie ernähren sich nun von Zitronensäure. Normalerweise kann E. coli damit nichts anfangen weil es die Zitronensäure nicht durch seine Membran transportieren kann. Anders sieht es in den von Lanski beobachteten Bakterien aus, diese besitzen nun die Fähigkeit dazu und können damit auch gut leben da sie offensichtlich so mutiert sind, dass sie die Zitronensäure durch ihre Membran kriegen.

Aber das soll hier auch als Einführung reichen, denn nicht nur das Experiment ist sehr cool weil man Evolution hier direkt beobachten kann. Das Team von Lanski bietet das komplette Paper mit den Ergebnissen kostenlos als PDF zum Download an. Und das ist ja leider nicht selbstverständlich.

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Gestern hab ich es auch noch geschafft Microcosm durchzulesen und bin kurz vor Schluss auf ein sehr lustiges Experiment gestoßen. Die im Buch erwähnte Kamera aus Escherichia coli kannte ich schon, aber die blinkenden (2000er Paper aus Nature, frei verfügbar) E. colis waren mir neu.
Die Forscher haben ein künstliches Netzwerk aus 3 Genen aufgebaut.Dabei war Gen A ein Repressor für Gen B, fusioniert mit dem Grün fluoreszierenden Protein. Gen B als Repressor für Gen C und Gen C der Repressor für Gen A, ein hübscher kleiner Kreislauf also der dazu führt, dass die Bakterien anfangen zu blinken.
Denn ist Gen A aktiv leuchtet das E. coli grün, unterdrückt jedoch gleichzeitig auch Gen B, damit wird Gen C aktiv. Dieses kann nun seinerseits Gen A stoppen, das Leuchten hört auf. Dadurch wird allerdings Gen B aktiv, was Gen C stoppt. Und damit hätten wir einmal den kompletten Kreislauf gemacht. Gen A wird wieder aktiv.

Ein hübsches und anschauliches Experiment, jedoch mehr Proof Of Concept als praktischer Nutzen würden die meisten sagen. Ich finde man könnte daraus lustige Lichterketten inklusive Farbwechseln basteln, wenn man an die anderen Gene nun noch andersfarbig fluoreszierende Proteine bastelt. Und wenn man Photoautotrophe Bakterien nutzen würde müsste man die nicht einmal wirklich füttern. Bliebe nur die Frage womit man die Fluoreszenz anregt.

Das Schweizer Armeemesser wird heute 111 Jahre alt und es hat mittlerweile schon viel erlebt. Mit MacGyver hat es manches Abenteuer erlebt, es ist mit der NASA ins All geflogen und wurde an die Multimediagesellschaft angepasst dank USB-Stick und MP3-Playerfunktionen.

Und ich hätte es fast verpasst wenn ich denn nicht bei Wired darüber gestolpert wäre. Und das wo ich doch auch schon seit Jahr und Tag eins mit mir herumtrage, am Schlüsselbund. Die vermutlich am meisten von mir verwendeten Funktionen sind dabei (in keiner besonderen Reihenfolge): Flaschenöffner, Korkenzieher, Dosenöffner. Und ja, von Zeit zu Zeit auch mal das Messer obwohl es sich an den Standardmodellen von Victorinox nicht feststellen lässt.

Herzlichen Glückwunsch.

Unglaublich, wieso hab ich eigentlich noch nie auf Yahtzees Kolumne Zero Punctuation hingewiesen die jeden Mittwoch einen so fantastischen Videospiel-Review-Rant publiziert? Egal, ist ja nun geschehen.

Oder wie PZ Myers so schön sagt:

"It should be "complexity", not "purity", and the arrow should point to the left. And obviously it should be arranged so that the biologist is on top — the others don't have a cephalopod."

Dem ist wohl nichts hinzuzufügen. Außer der Frage: Wieso gibt es so verdammt wenige deutschsprachige Wissenschaftsblogs?

Gestern war das Studentenfest des AStA vor dem Schloss. Mit viel Regen was Open-Air auch nicht ganz so attraktiv machte. Die Fotos sind von der Latino-Band Eseye.

Das ist es womit ich gerade Zeit verbringe, ich schreib für die Uni in BioInformatik einen Report, unter anderem mit lustigen phylogenetischen Bäumen. Nebenbei lese ich noch Carl Zimmers Microcosm (was ich bislang sogar Leuten empfehlen kann die Mikrobiologie langweilig finden) und Darwins The Descent Of Men was an sich auch sehr gut ist, allerdings im Original anstrengend zu lesen ist.

...auch mich. Schuldig gleich mehrerer Anklagepunkte.Was aber gar nicht so schlimm ist. Die freethoughtpedia setzt den verrückten, amerikanischen, christlichen Sekten dafür einfach mal Fakten entgegen. Und ich muss sowieso jedesmal schmunzeln wenn ich in The Descent Of Man lese, dass Darwin viele seiner Ideen von christl. Priestern bekommen hat.

[via]

Gestern war die Auftaktveranstaltung zu den Münster Classics vor dem Schloss und da ich den ganzen Tag in der Uni war hab ich davon auch was mitbekommen. Heute war dann wohl die eigentliche Veranstaltung irgendwo.